ഇന്ത്യ ഉൾപ്പെടെയുള്ള പല രാജ്യങ്ങളുടെയും മൺസൂണിനെ എൽ നിനോ നേരിട്ടോ പരോക്ഷമായോ സ്വാധീനിക്കാറുണ്ട്. സാധാരണയായി എൽ നിനോ വർഷങ്ങളിൽ ഇന്ത്യയിൽ മൺസൂൺ മഴയുടെ വിതരണത്തിൽ അസന്തുലിതാവസ്ഥകൾ ഉണ്ടാകാൻ സാധ്യത കൂടുതലാണ്.